La Minuad exerce l'unité de commandement et de contrôle des NU. Son patron, le Congolais Adada, responsable du maintien de la paix et de la mise en oeuvre du mandat et son assistant; le Ghanéen Anyodo, rendent compte au Président de l'UA et au Secrétaire général des NU. Le général Martin Luther Agwai et le Commissaire spécial rendent compte à Adada.

Les quatre hommes sont nommés par l'UA ET les NU. La direction de l'opération se fait selon les procédures des NU. Les quartiers généraux de l'UA et des NU sont censés se coordonner avec le Mécanisme de coordination de l'UA. L'ensemble souffre donc d'une certaine incohérence : les NU pensent commander l'action puisqu'elles paient et l'UA seule montra bien des faiblesses.

Pendant la phase de planification, il y eut des frictions La loyauté africaine irait moins aux NU qu'à l'UA et le soutien de celle-ci au Soudan est sans failles. Ainsi, selon AWN, la force hybride avait envoyé un enquêteur sur des attaques de civils dans sa zone. L'hélicoptère est arrivé et reparti immédiatement. Son responsable a donné comme raison à ses supérieurs auxquels il eût dû obéir, qu'il n'avait pas l'autorisation de Khartoum, autorisation non exigée par le SOFA.

Selon Jair van der Lijn (Paint the Nile Blue), Adada fut accusé de nommer ses amis aux postes élevés. Il a fait des promesses inconsidérées de MSA* aux dirigeants rebelles et peut avoir perdu sa crédibilité à leurs yeux. Il est parti à New-York en laissant les problèmes importants à son assistant. Toutefois, le chef d'Etat-major britannique est excellent .

L'infrastructure est absente. Les camps militaires doivent encore être construits, l'eau fournie, etc.. La société Dynacore doit s'en occuper mais son personnel n'avait pas reçu de visa fin février. Des forces additionnelles sont entraînées par les NU. La moitié du personnel doit venir des NU et l'autre de l'UA. Les NU auront de la peine à trouver à l'UA des gens qualifiés puisque leur niveau est très élevé. La rumeur court qu'elles embaucheront un personnel moins qualifié, africain, pour les postes élevés sous les ordres duquel travaillera un personnel plus compétent, asiatique ou occidental. La Minuad doit mettre en oeuvre des QIP (projets à impact rapide VS).

Les rebelles craignent autant de l'Egypte que de la Chine que leurs hommes servent de service de renseignements à Khartoum. Outre des Egyptiens et des Ethiopiens la Minuad attend 800 Tanzaniens. Khartoum a demandé à l'Indonésie de doubler ses casques bleus, 140 hommes. Le Rwanda a organisé un atelier, offert par les Etats-Unis, pour les officiers de 17 Etats africains, où les vétérans de l'UA au Darfour donneront leurs points de vue sur les problèmes qu'ils ont connu et les solutions qu'il entrevoient. Les NU recherchent 6 hélicoptères d'attaque et 18 de transport depuis des mois. Elles ont accepté 4 hélicoptères d'attaque d'Ethiopie et discutent hélicoptères de transport avec l'Ethiopie et le Bangladesh. La Russie pourrait en fournir.

*Le MSA est l'indemnité mensuelle de 600 $ promise aux représentants à la Commission du cessez-le feu du temps de l'AMIS. Elle ne ne fut plus réglée par manque de fonds. La Commission est paralysée car les représentants ont demandé le règlement des mois précédents (VS).