Les problèmes dans la formation du gouvernement vinrent d’abord des ministrables sollicités par Salva Kiir, premier vice-président et président du Sud-Soudan ; la plupart préfèrent un poste dans le gouvernement du Sud-Soudan et ce n’est pas cumulable.
Pour les Affaires Étrangères, on avait tout d’abord parlé de Nhial Deng, qui fut élevé dans le Nord par la famille du Mahdi après le meurtre de son père, un homme politique, dans des circonstances mal élucidées, de Pagan Amum, porte-parole du MLPS, qui fut finalement choisi comme leader du groupe parlementaire MLPS ou encore de Deng Alor, ancien secrétaire particulier de Garang et Dinka Bor comme lui, arabisant formé au Caire, connaissant bien les Américains et capable de mener un jeu particulier indépendant. Deng fut finalement nommé ministre des Affaires du Cabinet.
Le MLPS a le ministère de l’Éducation avec un Dinka professeur de Droit en Allemagne, Peter Niyot Kok, pour l’éducation supérieure. Deux étonnements, l’ancien ministre de l’Intérieur Abdel Rahim Hussein qui avait dû démissionner de son poste de Ministre de l’Intérieur dans des conditions rocambolesques (lire VS n° 131) se retrouve à la Défense, et un civil universitaire est à l’Intérieur, le premier civil depuis le coup d’État. Les conseillers du Président font aussi partie du cabinet ce qui a permis de réintégrer les ministres qui avaient dû céder leur place au MLPS. Parmi eux, l’ancien ministre des Affaires Étrangères, Mustafa Osman. On remarque également un ancien ministre des Affaires Étrangères de Nimeiri devenu conseiller de Garang, Mansour Khaled, et un journaliste qui était établi à Oxford, Bona Malwal.
Deux opposants du Sud ont été nommés. Les opposants du Nord sont de faux opposants ralliés, les vrais opposants (DUP, Umma, Congrès National Populaire) ayant jusqu’à présent décliné l’honneur. Les deux mouvements rebelles du Darfour ont critiqué la formation de ce gouvernement qui dénie aux peuples marginalisés les plus minces de leurs aspirations.

Salva Kiir a recommandé aux ministres de lire soigneusement l’accord de paix. Il parle à divers groupes de population du Nord, dit que le MLPS s’efforce d’obtenir l’unité, que les crises du Darfour et de l’Est doivent être promptement réglées, faute de quoi la guerre pourrait resurgir dans le Sud.

Le quartier général du MLPS est sis à Kafouri, un quartier résidentiel fort élégant de Khartoum Nord.
Le rapport d’enquête sur la mort de Garang est repoussé à mi-décembre.