- Le Soudan et l’Ouganda avaient repris leurs relations diplomatiques, rompues en 1995, car le Soudan accusait l’Ouganda de soutenir l’ALPS tandis que l’Ouganda accusait le Soudan de soutenir les rebelles de la Lord Resistance Army, la LRA, un groupe sous l’égide de Joseph Kony pratiquant l’enlèvement et la torture à grande échelle. Le Soudan a renouvelé un protocole autorisant l’armée ougandaise à poursuivre la LRA au Soudan pendant 5 mois, jusqu’au 31 08. Un membre de l’initiative de paix avec la LRA des leaders religieux Acholi (Ouganda) a déclaré avoir entendu d’anciens « prisonniers » de la LRA, en fait un major, un sergent et quatre autres membres de la LRA, parler de camions d’aide militaire livrée à Joseph Kony. Bien qu’au début de l’opération contre la LRA, cette dernière ait combattu férocement l’armée soudanaise, les choses semblent avoir changé depuis juillet 2002 où la LRA aurait aidé les troupes gouvernementales soudanaises à reprendre Torit.
Museveni, le président ougandais a déclaré que des combattants du réseau d’Al Qaida qui étaient au Soudan jusqu’à récemment, aidaient la LRA. Il ajouta que si l’Ouganda avait soutenu les Etats-Unis dans leur guerre en Irak, c’est «  parce que nous savions que si Saddam Hussein avait des armes de destruction massive, le Soudan les aurait aussi ; ils sont alliés. Très proches ». Le ministre des affaires étrangères soudanais répliqua que si par de telles accusations le gouvernement ougandais voulait exercer des pressions sur le Soudan [afin qu’il combatte la LRA], il se trompait. Le ton monta, tout le monde s’échauffa, quand Museveni déclara que le Soudan n’avait pas commis l’irréparable, donner une base à la LRA sur son territoire. Le Soudan, se souvenant  que Bush se rendait en Ouganda,  accepta la venue d’une délégation ougandaise. Celle-ci vint avec un rapport de 60 pages, apportant des preuves, donnant des noms et demandant à Khartoum de punir sévèrement les coupables (The Monitor, Kampala 02 06, Xinhua 11 06, 21 06, AP 13 06, 15 06, New vision, Kampala 17 06, IRIN 19 06, AFP 20 06, 23 06, 05 07, , dpa 20 06, Reuter 05 07).
Cinq civils ougandais ont été tués par des membres de l’ALPS ( Xinhua 15 06).

- Le Soudan a condamné six personnes à 10 ans de prison pour avoir essayé de faire passer en fraude aux rebelles du Darfour, un camion transportant 2500 balles de fusil et des uniformes militaires. Le camion a été arrêté à Omdurman la ville jumelle de Khartoum (Reuter, 06 07).

- L’attaque et la capture d’Akobo le 6 juin par l’ALPS sur le SSLM (milice gouvernementale) fut décrite par l’ALPS comme une affaire locale, mais elle fut dirigée par les commandants ALPS Johnson Gony, Moses Chol Rit et Doyak Chol. 
Les combats continuent dans le Haut-Nil Est dans la province de Nasir. Une milice pro-gouvernementale a capturé Mading. L’ALPS a contre attaqué et l’a recapturée.
Khartoum enverrait huit barges de matériel militaire à Juba en contravention à l’addendum en date du 04 02 au mémorandum d’entente signé avec l’ALPS (Reeves 07 07).
 Ces violations du cessez-le-feu soulignent l’importance d’équipes de surveillance.